在母藏獒出现发情预兆后，就要着手选择一条优良的公獒作其配偶，公獒的品质将直接关系到下一代獒仔的优劣，要选择无退化现象，神经种类稳定，体质健壮，成长发育快抗病力和繁殖能力都强的藏獒。配种的最好机会应在母獒阴部流血后的12-13天间。
这个时候母獒开始排卵，生殖道已为交配做好了筹备，母獒也表现出想交配的征兆有哪些，如阴门充分肿胀甚至外翻，分泌物的量降低并且由开始时的血样粘液渐渐变成浅色或不见血，如用手按压母獒腰部或扶按尾部，则站立不动，尾巴抬起偏向一侧，阴部频频开闭。遇公獒则频频排尿，表示想接近公獒，让公獒嗅其阴部，同意公獒爬跨，有是还爬跨公獒，表现愈加强的行为。见上面这类预兆后，要尽快让其交配。
必须要在母藏獒交配欲最强，发情预兆最明显时交配。配种次数以两次为好，即初配和复配。两次相隔距离的时间以24-48小时为宜，以免影响胎儿的发育。交配的地址最好是在母獒生活的地方，不要多人围观，以免在交配过程中收到惊吓，影响交配。交配时以自然办法为主，辅以人工帮助办法。交配时，应该注意不要刺激藏獒，注意安全。
当公藏獒松脱后，会各自舔阴部，不可立刻牵拉躯干，特别是公獒，在交配后常会出现腰部凹陷，俗称掉腰子切不可让其剧烈运动。交配后也不可让其立刻饮水，应休息一会儿，活动一会再让其饮水。交配时间，夏天最好在清晨或傍晚，冬天则以中午交配唯宜。交配前最好不要喂食或不要喂得过饱，以免因食后立即交配而引起呕吐。
